利用接地時產生的零序電流使保護動作的裝置即為零序電流保護，在運行中的問題主要涉及以下幾個方面：
較靈敏保護的共同弱點：當電流回路斷線時，可能造成保護誤動作；防止此類誤動作的方法利用相鄰電流互感器零序電流閉鎖。
零序電流保護啟動主要是因電力系統出現不對稱運行引起，如變壓器三相參數不同所引起的不對稱運行，單相重合閘過程中的兩相運行，三相重合閘和手動合閘時的三相斷路器不同期，母線倒閘操作時斷路器與隔離開關并聯過程或斷路器正常環并運行情況下，由于隔離開關或斷路器接觸電阻三相不一致而出現零序環流，以及空投變壓器時產生的不平衡勵磁涌流等等。
地理位置靠近的平行線路，當其中一條線路故障時，可能引起另一條線路出現感應零序電流，造成反方向側零序方向繼電器誤動作。防止此類誤動作的方法可以改用負序方向繼電器來防止誤判斷。
由于零序方向繼電器的交流回路沒有零序電流和零序電壓，回路斷線不易被發現，當交流回路出現問題，造成電網故障時誤動作。
